Los genes que se transcriben en un único transcrito de rna mrna se traducen en una única proteína

Los genes “housekeeping” son genes típicamente constitutivos que son necesarios para el mantenimiento de funciones celulares basales esenciales para la existencia de una célula, independientemente de su papel específico en el tejido u organismo. Así, se expresan en todas las células de un organismo en condiciones normales y fisiopatológicas, independientemente del tipo de tejido, la fase de desarrollo, el estado del ciclo celular o la señal externa.

Adquieren valor científico de dos maneras. Por un lado, representan el conjunto mínimo de genes necesarios para mantener la vida. Por otro lado, los genes Housekeeping se utilizan ampliamente como controles internos en estudios experimentales1. La fiabilidad de cualquier experimento de RT-PCR relativa puede mejorarse incluyendo un control endógeno invariante (gen de referencia) en el ensayo para corregir las variaciones de muestra a muestra en la eficiencia de la RT-PCR y los errores en la cuantificación de la muestra. Un informe biológicamente significativo del número de copias del ARNm diana requiere una normalización precisa y relevante con respecto a algún estándar y se recomienda encarecidamente en la RT-PCR cuantitativa.

¿Qué es el gen housekeeping?

Históricamente, los genes de mantenimiento se han definido como genes que se expresan de forma constante en todos los tejidos, son esenciales para el mantenimiento celular y se conservan en todas las especies.

¿Qué son los genes de mantenimiento del hogar?

Los genes de mantenimiento comúnmente utilizados en la Q-RT-PCR incluyen beta actina (ACTB), gliceraldehído-3-fosfato deshidrogenasa (GAPDH), subunidad pequeña del ribosoma (18S), ARN ribsosomal (ARNr), ubiquitina C (UBC), hipoxantina guanina fosforribosil transferasa (HPRT), complejo succinato deshidrogenasa, subunidad A (SDHA) y tirosina 3-…

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¿Qué son unos buenos genes domésticos?

¿Qué es un gen Good Housekeeping? La definición de un buen gen “housekeeping” es aquella que tiene una expresión estable en condiciones variables, por lo que puede utilizarse para normalizar otras influencias que puedan sesgar el resultado.

Genes de referencia en PCR en tiempo real

ResumenAntecedentesLos genes de control, a menudo denominados genes housekeeping, se utilizan con frecuencia para normalizar los niveles de ARNm entre diferentes muestras. Sin embargo, el nivel de expresión de estos genes puede variar entre tejidos o células y puede cambiar en determinadas circunstancias. Así pues, la selección de genes housekeeping es fundamental para los estudios de expresión génica. Para abordar esta cuestión, se investigaron 7 genes housekeeping candidatos, incluidos varios de uso común, en reticulocitos humanos aislados. Para ello, se empleó un sencillo enfoque ΔCt comparando la expresión relativa de “pares de genes” dentro de cada muestra. Sobre esta base, se clasificó la estabilidad de los genes “housekeeping” candidatos en función de la repetibilidad de las diferencias de expresión génica entre 31 muestras.ResultadosEl cribado inicial del patrón de expresión demostró que 1 de los 7 genes se expresaba a niveles muy bajos en los reticulocitos y se excluyó de los análisis posteriores. El rango de estabilidad de expresión de los otros 6 genes fue (de más estable a menos estable): GAPDH (gliceraldehído 3-fosfato deshidrogenasa), SDHA (succinato deshidrogenasa), HPRT1 (hipoxantina fosforribosil transferasa 1), HBS1L (proteína similar a HBS1) y AHSP (proteína estabilizadora de la hemoglobina alfa), seguidos de B2M (beta-2-microglobulina). ConclusiónSiguiendo este sencillo método, el GAPDH resultó ser el gen de mantenimiento más adecuado para los estudios de expresión en reticulocitos, mientras que el B2M, utilizado habitualmente, debería evitarse.

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Proteína de mantenimiento

ResumenLa expresión génica diferencial normalizada con respecto a una única proteína de mantenimiento (HK) se utiliza para identificar mecanismos patológicos y dianas terapéuticas. La selección del gen HK suele ser arbitraria, lo que puede introducir errores sistemáticos y resultados discordantes. Aquí examinamos estos riesgos en un modelo de enfermedad de hipoxia cerebral. En primer lugar, identificamos los ocho genes HK más utilizados mediante una revisión sistemática. Sin embargo, observamos que tanto ex vivo como in vivo, sus niveles de expresión variaban considerablemente entre condiciones. Al aplicar estos genes para normalizar los niveles de expresión del gen diana validado del ictus, el Nox4 inducible, obtuvimos resultados opuestos. Como herramienta alternativa para la selección no sesgada de genes HK, existen programas informáticos, pero se limitan a conjuntos de datos individuales que carecen de capacidad de búsqueda en todo el genoma y de interfaces fáciles de usar. Por lo tanto, desarrollamos el algoritmo HouseKeepR para analizar rápidamente múltiples conjuntos de datos de expresión génica de forma específica para cada enfermedad y clasificar los genes HK candidatos según su estabilidad de forma imparcial. Utilizando un panel de genes HK de novo mejor clasificados para la hipoxia cerebral, pero no genes individuales, se reprodujo de forma consistente la inducción de Nox4. Así pues, el análisis de la expresión génica diferencial se normaliza mejor con un panel de genes HK seleccionados de forma imparcial. HouseKeepR es la primera herramienta fácil de usar, libre de sesgos y ampliamente aplicable para proponer automáticamente genes HK adecuados en función del tejido y la enfermedad.

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Gapdh

En biología molecular, los genes “housekeeping” suelen ser genes constitutivos necesarios para el mantenimiento de la función celular básica, y se expresan en todas las células de un organismo en condiciones normales y fisiopatológicas[1][2][3][4] Aunque algunos genes “housekeeping” se expresan a tasas relativamente constantes en la mayoría de las situaciones no patológicas, la expresión de otros genes “housekeeping” puede variar dependiendo de las condiciones experimentales[1][5].

El origen del término “gen housekeeping” sigue siendo oscuro. La literatura de 1976 utilizaba el término para describir específicamente el ARNt y el ARNr[6]. Para fines experimentales, la expresión de uno o varios genes de mantenimiento se utiliza como punto de referencia para el análisis de los niveles de expresión de otros genes. El criterio clave para el uso de un gen housekeeping de esta manera es que el gen housekeeping elegido se exprese uniformemente con baja varianza tanto en condiciones de control como experimentales. La validación de los genes de mantenimiento debe realizarse antes de su uso en experimentos de expresión génica como la RT-PCR. Recientemente se ha desarrollado una base de datos en Internet de genes de mantenimiento y genes/transcritos de referencia humanos y de ratón, denominada Atlas de Transcritos de Mantenimiento y Referencia (Atlas HRT), para ofrecer una lista actualizada de genes de mantenimiento y genes/transcritos de referencia candidatos fiables para la normalización de datos de RT-qPCR[1]. Se puede acceder a esta base de datos en http://www.housekeeping.unicamp.br.